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| Titre de l’article | Auteur | Année | N° |
| Note sur Toussaint-Louverture | Clerc | 1900-01 | 2 |
| Etude bactériologique sur les sources d’Arcier | Marechal | 1900-01 | 2 |
| Notice biographique sur le Dr Faney | Magnin | 1903 | 6 |
| Additions aux recherches à entreprendre dans le Jura | Magnin | 1906 | 12 |
| Les variétés du bacille tuberculeux et les espèces acido-résistantes | Marechal | 1906 | 12 |
| C.R. de la session de la Société mycologique de France à Nancyen octobre 1905 | Rivet | 1906 | 12 |
| C.R. exposition de champignons d’octobre 1905 | Rivet | 1906 | 12 |
| C.R. du 6e congrès des Sociétés savantes de Franche-Comté à Vesoul | Hillier | 1907 | 13 |
| Canot démontable | Merel | 1907 | 13 |
| C.R. du 7e congrès des Sociétés savantes de Franche-Comté à Belfort | Hillier | 1907 | 14 |
| Notice sur le Dr Carrey | Magnin | 1908 | 15 |
| C.R. du 8e congrès des Sociétés savantes de Franche-Comté à Salins | Hillier | 1908 | 16 |
| La 23e livraison des Icônes de Boudier | Bataille | 1909 | 17 |
| Rapport sur les travaux de la Délégation pour l’adoption d’une langue auxiliaire internationale | Vincent | 1909 | 17 |
| Les Oeuvres d’Histoire Naturelle | Nodier Charles | 1911 | 20 |
| Compléments | Magnin | 1913 | 25 |
| La société d’Histoire Naturelle du Doubs et les services qu’elle a rendus depuis sa fondation (1899-1912) | Magnin | 1913 | 25 |
| Notice sur Amédée COPPEY | Magnin | 1913 | 27 |
| J. VIRIEUX, sa vie, ses travaux | Magnin | 1914-16 | 29 |
| Le professeur et naturaliste CHARBONNEL (de Saint-Claude) | Magnin | 1919 | 31 |
| Notice nécrologique sur A. Duvernoy | Barlot | 1920-23 | 33 |
| Notice nécrologique sur A. Sancey | Fournier | 1920-23 | 33 |
| Rapport sur le fonctionnement de la Société en 1920 | Fournier | 1920-23 | 33 |
| Rapport sur le fonctionnement de la Société en 1921-1922 | Fournier | 1920-23 | 33 |
| Tombes médiévales à Clerval | Huguenotte | 1923-26 | 34 |
| L’œuvre du physicien naturaliste hindou : Sir Jagadis Chunder Bose | Arcey | 1929 | 38 |
| Les états colloïdaux de la matière | Arcey | 1930 | 39 |
| Les véritables inventeurs du cinématographe sont les frères Limière | Maldiney | 1930 | 39 |
| La S.H.N.D. au 65e congrès des Sociétés savantes de France | Hillier | 1932 | 41 |
| Causalité et finalité | Martinet | 1933 | 43 |
| C.R. de la sortie annuelle de la S.H.N.D. (1.7.1935) | Thirode | 1935 | 46 |
| C.R. du congrès des Sociétés savantes de Franche-Comté à Montbéliard | Dreyfuss | 1935 | 46 |
| Le bacille thermophile et la thermo fermentation des ordures ménagères | Marechal | 1937 | 48 |
| Les principes de l’Evolution des êtres vivants | Martinet | 1938 | 49 |
| Sur un cas de morsure de vipère avec réaction sérique précoce | Carraud | 1942-45 | 51 |
| La loi de l’uniformité du travail du cœur de De CYON-MAREY et son remplacement par celle de l’uniformité de son débit | Marceau | 1942-45 | 51 |
| Années de pluie | Becker | 1957-58 | 61 |
| Présentation de films de recherche | Tronchet | 1959-60 | 62 |
| Utilisation de résines polymérisables en vue de l’inclusion de matériel végétal | Tavant | 1962 | 64 |
| Quelques aspects du monde des particules élémentaires | Froehly | 1967 | 69 |
| L’enseignement de la biologie dans le second degré | Roux | 1969 | 71 |
| Naissance de la Fédération | Roux | 1969 | 71 |
| Identification de particules végétales intrabronchiques après inhalation d’eau de mer | Raton et Millet B. | 1971 | 73 |
| De la biologie du comportement animal à la biologie du comportement de l’enfant | Montagner | 1972 | 74 |
| La rage et son extension en Franche-Comté | Chazot | 1974 | 76 |
| L’alimentation des Français | Baudier | 1983 | 81 |
| Evolution de la pensée biologique au XXIe siècle | Gallinet | 1988-91 | 84 |
| Incursion au Mali Central | Aberlin | 1992-95 | 86 |
| Les premières dizaines d’années de la Société d’Histoire Naturelle du Doubs | Baillaud L. | 1996-98 | 87 |
| Le Professeur Antoine Tronchet, 1902-1990, et la botanique à Besançon | Baillaud L. | 1996-98 | 87 |
| Visage | Langlois D. | 2000-01 | 88 |
| Sur les traces de l’esprit sauvage | Le Pennec C. | 2000-01 | 88 |
| Photographier la faune, une démarche naturaliste | Michel J. | 2000-01 | 88 |
| Dessin ou photographie de nature ? | Michelat J.-M. | 2000-01 | 88 |
| Le dessin buissonnier | Marle Ph. | 2000-01 | 88 |
| Le malin génie de l’image ou quelques réflexions sur le pouvoir de la photographie | Trimaille G. | 2000-01 | 88 |
| Recherches bactériologiques dans du guano de chauves-souris Chiroptera | Hamon | 1988-91 | 84 |